Le coordinateur du Labex PALM, Philippe Mendels et la coordinatrice adjointe, Martine Soyer, tous deux approuvés par le conseil d’administration des 12 institutions, dirigent le comité de direction (CODIR) assisté pour toutes les parties opérationnelles par une chef de projet, Sarah Garçon. Le coordinnateur convoque les réunions du comité exécutif avant chaque comité de direction et chaque fois que nécessaire.
Philippe Mendels a repris la coordination de Pierre Pillet en 2015 dont les travaux ont abouti à une évaluation très positive et élogieuse du LabEx, tant du comité scientifique international que du jury international en 2015.